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Insegnamento: Biologia molecolare avanzata A.A. 2010/2011
Docenti: Anna Grazia Ficca
CFU: 6

Programma
Struttura e flessibilità conformazionale del DNA.
I parametri angolari e i loro gradi di libertà; curvatura intrinseca e curvabilità e loro
influenza nell'espressione genica. La necessità di compattare i genomi: diverse soluzioni di un unico problema. La topologia del DNA: avvolgimento e superavvolgimento, il numero di legame, le topoisomerasi. Strutture di ordine superiore del DNA batterico:componenti e gradi di compattamento. Implicazioni funzionali. Proteine istone-simile e loro coinvolgimento nella “regolazione globale” dell'espressione genica. La cromatina degli archea ed eucariotica: aspetti evolutivi. La struttura cromatinica dei promotori e i meccanismi di modificazione e controllo: acetilazione e deacetilazione, complessi di remodeling. Meccanismi di regolazione basati sul reclutamento - casi modello i geni di lievito (Gal, GCN4 e GCN5) ed umano (il gene dell'interferone beta). Le proteine architetturali "High Mobility Group" e loro ruolo nella regolazione genica.
☞Analisi degli RNA e sequenze collegate alla loro stabilità.
RNA splicing. RNA catalisi: molecole virali vegetali, ribozimi. Il ribosoma è un ribozima. Proteine che legano l'RNA e loro ruolo funzionale. La biologia molecolare del virus HIV: interazione delle proteine regolative (tat, rev) con il genoma virale. Aptameri ad RNA. Small RNAs: cambio di paradigma nello studio della regolazione genica. Storia, importanza, significato biologico, aspetti applicativi. Regolazione da sRNA in batteri. Regolazione da sRNA negli eucarioti: meccanismi molecolari di riconoscimento e processamento: Drosha, Pasha, export nucleare, DICER, gli argonauti, RISC, scelta del filamento, analogie molecolari di processamento. Meccanismi di inibizione della traduzione (miRNA). Amplificazione del silenziamento in piante e C. elegans. Curiosità ed ipotesi emergenti.
☞Appendice metodologica
Metodi per l'analisi delle interazioni proteine acidi nucleici. EMSA, DNA ed RNA footprinting, crosslinking ed immunoprecipitazione di complessi DNA ed RNA/proteine. Sistema del doppio ibrido. Tecniche di sequenziamento chimico del DNA per l'analisi del footprinting. Approcci metodologici allo studio della trascrizione: microarrays, i sistemi di trascrizione in vitro. Studio funzionale dei geni: silenziamento genico mediato da siRNA . Sistemi in vitro per lo studio della cromatina e modificazioni durante la trascrizione: sensibilità alle nucleasi. Biochip e biosensori ad RNA, Attameri ed evoluzione molecolare (SELEX).
Risultati di apprendimento














Propedeuticità obbligatorie
Propedeuticità consigliate
Biochimica, Biologia Molecolare, Genetica
Testi di riferimento
Testi principali di riferimento disponibili in Biblioteca ✒Lewin B, "Il Gene VIII", Oxford Press
✒Ptashne M, Gann A., "Geni e Segnali" Zanichelli, Bologna. Ediz. 2004
✒Watson et al. "Biologia Molecolare del gene" sesta edizione Zanichelli
L.A. Allison "Fondamenti di Biologia Molecolare" (ed. Zanichelli)

A piacere per consultazione ed approfondimento:
✒Weaver R.F: “Biologia Molecolare” McGraw-Hill Ediz. 2005
SCHEDE E MATERIALE AUSILIARIO VERRA' FORNITO DAL DOCENTE A LEZIONE
Modalità di esame
Esame Orale
Commissione di Esame
Prof. Anna Grazia Ficca (Presidente)Prof. Elia Poerio (membro della commissione)Prof. Maurizio Ruzzi (membro della commissione)
Informazioni didattiche
Frequenza:Frequenza facoltativa
Modalità didattica:Lezioni frontali   
Organizzazione della didattica :
  • Lezioni: 48 Ore

Orario Lezioni:
Lunedì, Martedì, Mercoledì 11.00-13.00.; ; Ricevimento studenti: per appuntamento da definire inviando una e-mail a ficca@unitus.it
Inizio e fine lezioni:
Edificio: Facoltà di Scienze MM.FF.NN.; Aula: 1; Indirizzo: L.go dell'Università s.n.c. - Viterbo;
Statistiche dei voti
A: 0% (voti 30 e Lode)
B: 100% (voti 28-30)
C: 0% (voti 26-27)
D: 0% (voti 21-25)
E: 0% (voti 18-20)

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Docenti
Prossimi Esami
02/02/2011 Biologia Molecolare Avanzata Esame Scaduto
14/02/2011 Biologia Molecolare Avanzata Esame Scaduto
03/03/2011 Biologia Molecolare Avanzata Esame Scaduto
Questa Materia è presente nei seguenti curricula
Biotecnologie delle Produzioni Agrarie
Biotecnologie Industriali e Biocatalisi applicata
ex facoltà di Agraria - Università degli studi della Tuscia (Viterbo)